日本為台灣的重要鄰國，長久以來其農業的發展與我國關係密切，台灣曾導入許多日本的種源、生產模式及研發技術，而日本則由台灣進口許多農產品及種苗資材。東京農業大學多年來每年派有學生團到本校研習，研習課程包含台灣農業現況、產品釀造加工、動物科學、生物治療、園藝研究之上課及兩校學生農場實習、研究室分組實習及校外參訪。藉由兩校學生眾多交流活動，對農業、教育及社會文化之瞭解，促進兩校學生對國際農業合作及國際關係之關心。